Футбольный клуб «Истиклол» (Душанбе, Таджикистан) основан в 2007 году. Базируется на Центральном стадионе (вместимость — 22 000 человек). Президент клуба — Шохрух Саидзода. Главный тренер — Мухсин Муслимович Мухамадиев. Капитан — Фатхулло Фатхуллоев.

ФК «Истиклол» — таджикистанский футбольный клуб из города Душанбе. Выступает в национальном чемпионате Таджикистана среди команд высшей лиги. Домашним стадионом клуба является Центральный республиканский стадион, вмещающий 22 000 зрителей. Футбольный клуб «Истиклол» (Душанбе) образован в ноябре 2007 года. Президентом клуба является молодой Шохрух Саидов, а состав команды был амбициозным и готовым стремиться к вершинам таджикского футбола.

В сезоне 2008 года «Истиклол» выступал в чемпионате Таджикистана среди команд первой лиги. Под руководством главного тренера Каноата Латифова команда провела в первом дивизионе 35 игр и, одержав победы во всех проведенных матчах, завоевала право на переход в высшую лигу.

В 2009 году столичный клуб дебютировал в высшей лиге чемпионата Таджикистана. Команду возглавил новый главный тренер Салохиддин Гафуров. Вместе с ним в «Истиклол» пришли молодые и опытные игроки. Среди новичков были ребята, которые прошли школу юношеской сборной Таджикистана, выигравшие бронзовые медали чемпионата Азии в Сингапуре (2006) и участвовавшие на юношеском первенстве мира в Южной Корее (2007).

Дебютный сезон в первенстве для молодой команды, можно сказать, был притирочным, клуб занял четвертое место в турнирной таблице. В 18 проведенных играх «Истиклол» набрал 36 очков, одержав 11 побед, 3 матча свел вничью, и потерпел поражения в 4 встречах. Разница мячей составила 41–18. В 2009 году душанбинский клуб выиграл два трофея — традиционный зимне-весенний турнир Рустама Долтабаева и Национальный Кубок республики. А дублеры «Истиклола» в сезоне-2009 завоевали малые золотые медали.

В 2010 году «Истиклол» сделал своеобразный «хет-трик», выиграв Суперкубок, национальный Кубок и чемпионат Таджикистана. В первом в истории таджикского футбола Суперкубке страны душанбинский клуб, благодаря дублю Дилшода Восиева в дополнительное время, обыграл трехкратного чемпиона страны кургантюбинский «Вахш» со счетом 2:0.

В финальном матче за Кубок Таджикистана 2010, который по традиции проходил 5 октября – в день рождения Президента республики Эмомали Рахмона — «Истиклол» с крупным счетом 5:0 разгромил «Худжанд».

Первый круг национального чемпионата команда провела не совсем удачно. В результате в середине второго круга с поста главного тренера был отправлен в отставку Салохиддин Гафуров. На его место руководство клуба пригласило известного в прошлом защитника душанбинского «Памира» Алимджона Рафикова, который окончил Высшую школу тренеров в Москве и имеет тренерскую лицензию категории «В».

С приходом нового тренера команда преобразилась и после нескольких туров «Истиклол» вышел в единоличные лидеры в турнирной таблице. Чемпионство команда оформила за четыре тура до конца сезона, когда обыграла со счётом 2:0 турсунзадевский «Регар-ТадАЗ». Всего в чемпионате 2010 душанбинцы провели 32 игры и не потерпели ни единого поражения: 26 побед, 5 ничьих, разница мячей — 76-17, количество набранных очков — 84.

Стоит отметить, что по итогам 2010 года лучшим футболистом Таджикистана был признан капитан и форвард «Истиклола» Юсуф Рабиев, который отметился 30 мячами в ворота соперников. Лавры лучшего защитника достались 20-летнему Эраджу Раджабову. А Алимджон Рафиков был назван лучшим тренером года в стране.

В «Истиклоле» играют много молодых и перспективных игроков, которые являются членами национальной, молодёжной, олимпийской и юношеской сборных Таджикистана.

Выиграв чемпионат Таджикистана в сезоне 2010, ФК «Истиклол» впервые в истории получил право на участие в Кубке Содружества 2011, в котором дошел до четвертьфинала, и Кубке президента АФК-2011, где вышел в финальную часть соревнований. К сожалению, в финальной части третьего по значимости клубного турнира Азии команда выступила не совсем удачно.

В сезоне-2011 «Истиклол» сделал «дубль» выиграв Суперкубок и национальный чемпионат Таджикистана. По итогам 2011 года вратарь команды Алишер Туйчиев был признан лучшим голкипером, а форвард Юсуф Рабиев, став лучшим бомбардиром с 32-мя голами, выиграл приз “Лучшего нападающего”.

Сезон 2012 «Истиклол» начал удачно: команда в третий раз подряд выиграла Суперкубок страны, на этот раз под руководством нового главного тренера Николы Кавазовича. Сербский специалист возглавил душанбинский клуб в начале апреля, придя на смену предыдущему главному тренеру Алимджону Рафикову. В чемпионате Таджикистана 2012 наш клуб выиграл бронзовые медали. Кроме того, “Истиклол” стал обладателем Кубка президента АФК . — третьего по значимости клубного турнира Азии.

По итогам сезона 2012 Алишер Туйчиев был назван лучшим вратарем Таджикистана. Нуриддину Давронову достались лавры лучшего полузащитника страны, а капитан команды Дилшод Восиев получил призы лучшего бомбардира и лучшего футболиста Таджикистана 2012.

В первом круге чемпионата Таджикистана 2013 “Истиклол” провел 9 матчей, в которых одержал 8 побед и в одном матче потерпел поражение. После осечки в Кулябе от «Равшана» (0:1) главный тренер команды Никола Кавазович был отправлен в отставку. Новым наставником клуба стал знаменитый в прошлом полузащитник душанбинского «Памира», московского «Торпедо» и сборной СССР Олег Хакимбекович Ширинбеков, который по итогам сезона привел команду к серебрянным медалям чемпионата и к выигрышу национального Кубка. По итогам года голкипер команды Алишер Туйчиев в третий раз подряд был признан лучшим вратарем республики, капитан команды Дилшод Восиев во второй раз удостоился звания "Лучшего футболиста года", а иранский форвард Хусейни Сухроби с 11 мячами стал лучшим снайпером чемпионата. 

В январе 2014 года «Истиклол» возглавил Мубин Эргашев, который заменил уволенного Олега Ширинбекова. Команда провела сезон с блеском выиграв все всевозможные трофеи внутреннего чемпионата. В феврале на международном турнире Кубок санатория "Бахористон" с участием таджикских и казахских команд "Истиклолу" удалось одержать пять побед и стать обладателем престижной награды. Затем душанбинскому клубу покорились Кубок ФФТ и Суперкубок Таджикистана. Далее столичные футболисты за пять туров до конца чемпионата оформили третье чемпионство и 23 ноября в четвертый раз стали победителями Кубка Таджикистана. В сезоне 2015 "Истиклол" впервые дебютировал в розыгрыше Кубка АФК и дошел до финала турнира, тем самым став самым успешным дебютантом соревнований. На внутренной арене "Истиклол" во второй раз выиграл Кубок санатория "Бахористон",  Кубок ФФТ, в пятый раз стал обладателем Суперкубка Таджикистана и в четвертый раз выиграл золотые метали национального чемпионата а в заключительном матче сезона "Истиклол" в пятый раз выиграл Национальный Кубок.  В сезоне-2016 "Истиклол" не сумел выйти из группы в розыгрыше Кубка АФК.  После первого круга чемпионта страны Мубин Эргашев  был уволен и  временным исполняющим роли главного тренера был назначен Нумонджон Юсупов. По итогам сезона-2016 «Истиклол» как и год назад выиграл золотые медали чемпионата, став пятикратным обладателем золотых медалей, а также в шестой раз завоевал Кубок страны. 31 октября главным тренером команды стал Мухсин Мухамадиев.